O Alto Tietê ainda preserva cerca de 35 mil hectares da Mata Atlântica e a maior parte desse bioma está localizado em cidades como Mogi das Cruzes, com 15,1 mil hectares, Salesópolis, com 13,5 mil hectares e Biritiba Mirim, com 10,5 mil hectares. Para efeito de comparação, um hectare é o equivalente a um campo de futebol.
Apesar da grande quantidade desse bioma na região, o que resta da Mata Atlântica original não chega a 50%, mas a boa notícia é que o que ainda existe por aqui não sofreu grandes danos. O assunto de ecologia e preservação está em evidência graças ao que está ocorrendo na floresta amazônica, com a grande quantidade de queimadas - que fazem parte das etapas finais para preparar o solo para o pasto, ação feita depois do desmatamento.
No Alto Tietê, a história, pelo menos até agora, está caminhado melhor do que ocorre na região Norte. O último levantamento da Fundação SOS Mata Atlântica, com base em 2017 e 2018, apontou que o ritmo de desmatamento, não só na região como em todo o território brasileiro, caiu 9,3% em relação a 2016, desmatando 11,3 mil hectares no período. Outro fator positivo é que no Estado de São Paulo o desmatamento chegou a quase zero, segundo avaliação do SOS Mata Atlântica. Ainda assim, uma pequena parcela desse ecossistema em território paulista foi destruído: 96 hectares.
Para que essa preservação continue é preciso que as ações de contenção não sejam reduzidas nenhum milímetro. O que ocorre na Amazônia, com a política de afrouxamento do governo federal, não pode chegar aqui, afinal, o Alto Tietê faz parte do Cinturão Verde, com municípios produtores de água e alimentos.
Faz parte da manutenção do bioma a preservação de mata ciliares, próximas aos rios, que conseguem reter a água da chuva por mais tempo. Em um campo mais aberto, a água evapora mais rápido e pode não chegar nos reservatórios que abastecem o Sistema Produtor Alto Tietê (Spat).
Como se pode notar, a preservação da Mata Atlântica não está ligada apenas ao turismo, mas à própria sobrevivência dos moradores da região do Alto Tietê e de outras cidades do Estado.