O sistema de controle interno da Prefeitura de Mogi das Cruzes, em especial a atuação da Controladoria-Geral do Município e o planejamento da Secretaria de Educação, foi objeto de um trabalho acadêmico de alunos da Fundação Getúlio Vargas (FGV), uma das mais renomadas instituições de ensino superior do país, sobretudo na área de administração. O estudo resultou na dissertação "Balanced Scorecard como ferramenta de integração entre o Controle Interno e o Planejamento Orçamentário da Secretaria de Educação do Município de Mogi das Cruzes", para mestrado em Gestão e Políticas Públicas.
"A proposta da Controladoria, e que vem ao encontro do estudo elaborado na Fundação Getúlio Vargas, é implementar um controle das ações desde a elaboração do orçamento. Ou seja, o objetivo não é ser apenas um órgão de auditoria e fiscalização que aponte possíveis erros, mas ser uma ferramenta de planejamento e orientação para melhores práticas, visando aos melhores resultados, sobretudo para o cidadão", explica o controlador-geral do Município de Mogi das Cruzes, Antonio Cleber Castanho Almeida Jr., que participou da banca examinadora do trabalho, na FGV.
Segundo ele, a iniciativa de Mogi das Cruzes em ter um órgão de controle interno foi motivo de admiração e elogio de parte do corpo docente da instituição. "A forma como outras instituições estão vendo esta iniciativa da Prefeitura é muito positiva. É uma medida considerada inovadora. Estamos na vanguarda", completa.